- Дочерняя компания Alphabet, Isomorphic Labs, представила новый ИИ-движок для проектирования лекарств IsoDDE, превосходящий AlphaFold 3 более чем в два раза по точности.
- IsoDDE прогнозирует не только структуры белков, но и силу связывания молекул с белками, а также выявляет скрытые сайты связывания, что существенно ускоряет разработку препаратов.
- Технология уже получила поддержку крупных фармацевтических компаний Novartis, Eli Lilly и Johnson & Johnson, а клинические испытания лекарств, созданных с помощью IsoDDE, запланированы на конец 2026 года.
Компания Isomorphic Labs, дочерняя структура Alphabet и сестринская компания Google DeepMind, анонсировала новый вычислительный движок IsoDDE (Isomorphic Labs Drug Design Engine) для проектирования лекарственных молекул. Данный инструмент продемонстрировал выдающуюся точность на одном из самых сложных бенчмарков структурного предсказания Runs N’ Poses — 50% против 23,3% у аналогичного показателя AlphaFold 3. Это означает более чем двукратное превосходство над моделью, которая в 2024 году была признана прорывом в области биоинформатики.
Стоит отметить, что IsoDDE — это не усовершенствованная версия AlphaFold, а принципиально другой по масштабу и функционалу движок. AlphaFold 3 предсказывала трёхмерные структуры белков и их взаимодействия с молекулами, в то время как IsoDDE выполняет эти задачи точнее, а также способна решать две дополнительные задачи, критически важные для реальной разработки лекарств. Во-первых, движок может прогнозировать силу связывания потенциального препарата с мишенью-белком, что является ключевым показателем эффективности будущих лекарств. Во-вторых, система способна автоматически выявлять скрытые «карманы» белков — участки, к которым возможно присоединение лекарств, даже если они ранее не были обнаружены экспериментально.
Примером успешного применения IsoDDE служит анализ белка церебролон. В течение пятнадцати лет считалось, что у этого белка имеется лишь один сайт связывания — классический талидомидный карман. Недавние исследования выявили второй скрытый сайт, и IsoDDE смог воспроизвести это открытие, используя исключительно аминокислотную последовательность белка на входе без дополнительной информации. На это вычислительной системе потребовалось всего несколько секунд, тогда как традиционные экспериментальные методы, как фрагментный скрининг, требуют значительного времени и ресурсов.
Кроме работы с малыми молекулами, IsoDDE успешно анализирует взаимодействия антител и антигенов. В сравнительных тестах движок превзошёл AlphaFold 3 по точности в 2,3 раза и по сравнению с моделью Boltz-2 — почти в 20 раз при работе в режиме высокой точности. Такие возможности открывают перспективы для компьютерного проектирования антител, что ранее в основном осуществлялось лабораторными методами.
Фармацевтическая индустрия уже проявила серьезный интерес к новой технологии. Isomorphic Labs заключила крупные партнёрские соглашения с компаниями Novartis и Eli Lilly на общую сумму около 3 млрд долларов. В январе 2026 года был подписан контракт с Johnson & Johnson, который сфокусирован на разработке крупных молекул и биологических препаратов. В 2025 году стартап привлёк $600 млн инвестиций в первом внешнем раунде от Thrive Capital. В перспективе компания планирует запустить клинические испытания препаратов, созданных с использованием IsoDDE, уже до конца 2026 года.
Таким образом, представленный движок IsoDDE демонстрирует значительный шаг вперёд в использовании искусственного интеллекта для дизайна лекарств, сокращая сроки разработки и повышая точность предсказаний, что может коренным образом изменить фармацевтическую отрасль.
