- Учёные из Университета Джонса Хопкинса опубликовали открытый атлас развития человеческого неокортекса на основе данных о 30 млн клеток.
- В работе объединены результаты почти 200 независимых исследований, а сам атлас уже доступен через платформу NeMO Analytics.
- Авторы связывают ресурс с изучением ранних этапов нарушений развития мозга и болезней, включая аутизм, микроцефалию, шизофрению и болезнь Альцгеймера.
Учёные из Университета Джонса Хопкинса представили высокодетализированный атлас развития человеческого неокортекса и открыли к нему доступ через облачную платформу NeMO Analytics. Ресурс уже доступен исследователям и собирает воедино данные почти 200 работ, в которых суммарно проанализировали 30 млн клеток мозга.
Неокортекс — это внешние слои больших полушарий, которые связаны с восприятием, памятью, речью и принятием решений. Новый атлас показывает, как на клеточном уровне формируется эта часть мозга и какие гены включаются на разных этапах развития. По словам руководителя проекта Карло Колантуони, цель работы — понять, как строится неокортекс, и найти ключи к самым ранним стадиям задержек развития и тяжёлых заболеваний мозга.
Авторы подчёркивают, что речь не идёт о полной карте всего мозга: 30 млн клеток — лишь малая доля от общего числа клеток в человеческом мозге. Но для науки важна не тотальная «перепись», а возможность увидеть закономерности. Атлас помогает сопоставить типы клеток, их состояние и активность генов в конкретные периоды развития плода, то есть понять, когда и где могут возникать сбои.
Исследователи также сравнили человеческие данные с картами мозга мышей и макак. Это помогло точнее выделить особенности развития человека, в том числе более длительное созревание мозга. Такой подход важен для изучения генов, которые связывают с нарушениями развития, включая MEF2C и TCF4, и для поиска моментов, когда эти изменения могут влиять на формирование нервной системы.
Отдельная часть проекта — открытый доступ. Весь массив данных выложен на NeMO Analytics, где его можно изучать через веб-интерфейс. Это снижает порог входа для лабораторий, которым не нужно собирать такой набор данных самостоятельно, и даёт возможность перепроверять результаты, искать новые связи и строить собственные модели на общей базе.
Работа опубликована в Nature Neuroscience и опирается на объединение почти 200 независимых исследований. Параллельно Nature и Johns Hopkins Medicine выпустили материалы, в которых атлас описывается как один из самых подробных открытых ресурсов по развитию человеческого мозга.
Для исследователей это готовая база, по которой можно быстрее проверять гипотезы о нарушениях развития мозга и искать клеточные мишени для будущих лекарств. Для фармкомпаний и биомедицинских команд это источник данных, который может сократить время на ранний этап исследований.
